Finalización del Curso. 5
David Vásquez V. 13 Ene 202213/01/22 a las 14:43 hrs.2022-01-13 14:43:13
Estimados,
Ha sido un gusto tenerlos en el curso, espero que los contendios vistos puedan ser de utilizadad para su futuro como investigadores y su investigación actual.
Desde ya cuenten conmigo colegas.
Sldos.
Ha sido un gusto tenerlos en el curso, espero que los contendios vistos puedan ser de utilizadad para su futuro como investigadores y su investigación actual.
Desde ya cuenten conmigo colegas.
Sldos.
Trabajos de Investigación Finales. 5
David Vásquez V. 22 Dic 202122/12/21 a las 20:30 hrs.2021-12-22 20:30:22 Evaluacion Final
Estimados, acontinuación un resumen de los trabajos a realizar como evaluación final del curso.
Fernández Cabrera, Christian Daniel.
Generar al menos un ligando inhibidor de la proteasas TMPRSS11a, en el sitio catalítico de la enzima.
Se sugiere realizar un Virtual Screening de una base de datos extensa de fármacos, a partir de los resultados, generar una nueva base de dato para buscar mejores ligandos novedosos.
Campos Garces, Ivo Nicolas
Generar al menos un ligando con afinidad (potencial inhibidor) de al menos dos protesas que cortan al ligando MICA de membrana. Se sugiere realizar un Virtual Screening de una base de datos extensa de fármacos, a partir de los resultados, generar una nueva base de dato para buscar mejores ligandos novedosos.
Escrito.
Realizar un documento simple que presente los siguientes elementos:
1. Esquema como índice: Genere un esquema donde muestre cada etapa, proceso, herramienta y principal resultado realizado.
2. Para cada etapa indique la herramienta utilizada, los parámetros usados y discuta brevemente los principales resultados. Todo proceso que no resultó debe también ser colocado indicando el problema y su solución.
Entrega, en principio el 10 de enero, enviar a UCursos Tareas.
La entrega incluye los archivos:
- Documento de descrición de la investigación.
- Proyecto en Maestro.
Sldos.
Fernández Cabrera, Christian Daniel.
Generar al menos un ligando inhibidor de la proteasas TMPRSS11a, en el sitio catalítico de la enzima.
Se sugiere realizar un Virtual Screening de una base de datos extensa de fármacos, a partir de los resultados, generar una nueva base de dato para buscar mejores ligandos novedosos.
Campos Garces, Ivo Nicolas
Generar al menos un ligando con afinidad (potencial inhibidor) de al menos dos protesas que cortan al ligando MICA de membrana. Se sugiere realizar un Virtual Screening de una base de datos extensa de fármacos, a partir de los resultados, generar una nueva base de dato para buscar mejores ligandos novedosos.
Escrito.
Realizar un documento simple que presente los siguientes elementos:
1. Esquema como índice: Genere un esquema donde muestre cada etapa, proceso, herramienta y principal resultado realizado.
2. Para cada etapa indique la herramienta utilizada, los parámetros usados y discuta brevemente los principales resultados. Todo proceso que no resultó debe también ser colocado indicando el problema y su solución.
Entrega, en principio el 10 de enero, enviar a UCursos Tareas.
La entrega incluye los archivos:
- Documento de descrición de la investigación.
- Proyecto en Maestro.
Sldos.
Tarea Viernes 10 Diciembre. 6
David Vásquez V. 6 Dic 202106/12/21 a las 20:40 hrs.2021-12-06 20:40:06 Tareas
Estimados,
Les describo la tarea para el viernes.
En la albúmina utilizada, PDB 4LB9.
1. Cortar el ligando que es etopósido.
2. Preparar la proteína.
3. Filtrar en PubChem moléculas que sean:
5. Realizar la preparación de todos los igandos.
6. Buscar los sitios posibles de unión en la albúmina.
7. Crear las grillas de los sitios de unión encontrados.
8. Generar un Virtual Screening con Workflow.
Analizaremos los resultados el viernes.
Sldos. y Exito!
Consultas bajo este mensaje.
Les describo la tarea para el viernes.
En la albúmina utilizada, PDB 4LB9.
1. Cortar el ligando que es etopósido.
2. Preparar la proteína.
3. Filtrar en PubChem moléculas que sean:
- Farmacos.
- Contengan o sean similes a la estructura acetaldehido.
- Tengan un peso molecular menor a 500 Dalton.
5. Realizar la preparación de todos los igandos.
6. Buscar los sitios posibles de unión en la albúmina.
7. Crear las grillas de los sitios de unión encontrados.
8. Generar un Virtual Screening con Workflow.
Analizaremos los resultados el viernes.
Sldos. y Exito!
Consultas bajo este mensaje.
Coordinación de Clases. 4
David Vásquez V. 29 Oct 202129/10/21 a las 09:44 hrs.2021-10-29 09:44:29 Paso -1
Estimados,
Agradecido por darse el tiempo de reunirse.
Les envié el link del curso en la carpeta Drive, ahí trabajaremos.
Dudas escriban por acá o por el foro, como quieran.
Entonces comenzaríamos el día 29 de noviembre, y serían los lunes, miércoles y viernes de 9:00 a 12:00 h.
Terminaríamos la semana del 20 de diciembre.
Tareas hasta entonces serían:
1. instalar Linux Mint Cinnamont en sus computadores.
2. Familiarizarse con el uso de la consola para actualizar e instalar programas en linux.
3. Instalar los programas y además el zoom.
4. Todo documento o presentación la realizaremos en las apps de google drive, así que no requieren instalar otro software.
5. Sugiero como navegador el Chrome para linux.
Les voy a colocar algunos links de interes para el curso en UCursos.
quedo atento...
Agradecido por darse el tiempo de reunirse.
Les envié el link del curso en la carpeta Drive, ahí trabajaremos.
Dudas escriban por acá o por el foro, como quieran.
Entonces comenzaríamos el día 29 de noviembre, y serían los lunes, miércoles y viernes de 9:00 a 12:00 h.
Terminaríamos la semana del 20 de diciembre.
Tareas hasta entonces serían:
1. instalar Linux Mint Cinnamont en sus computadores.
2. Familiarizarse con el uso de la consola para actualizar e instalar programas en linux.
3. Instalar los programas y además el zoom.
4. Todo documento o presentación la realizaremos en las apps de google drive, así que no requieren instalar otro software.
5. Sugiero como navegador el Chrome para linux.
Les voy a colocar algunos links de interes para el curso en UCursos.
quedo atento...
