Actividades Semana 11 de Noviembre 2
Matías Alarcón M. 11 Nov11 de Noviembre a las 11:58 hrs.2024-11-11 11:58:11
Estimado Nico, espero estés súper.
Escribo esta novedad para comentarte que hemos decidido que Lactobacillus reuteri es la opción más interesante para evaluar por qPCR, por lo que realicé una búsqueda en la literatura de partidores (subí los artículos a Material Docente).
Así la primera tarea oficial de la pasantía, será evaluar las parejas de partidores propuestas siguiendo las instrucciones que te dejé en la tarea, para así seleccionar cuál debemos pedir para los experimentos. La fecha de entrega de esta tarea es el Jueves 28 de Noviembre en la noche, por lo que tendrás harto tiempo para hacerla.
Por último, este Jueves a las 10 am realizaremos la primera prueba piloto del protocolo para extraer el DNA desde una de las muestras que tenemos!
Nos vemos!
Escribo esta novedad para comentarte que hemos decidido que Lactobacillus reuteri es la opción más interesante para evaluar por qPCR, por lo que realicé una búsqueda en la literatura de partidores (subí los artículos a Material Docente).
Así la primera tarea oficial de la pasantía, será evaluar las parejas de partidores propuestas siguiendo las instrucciones que te dejé en la tarea, para así seleccionar cuál debemos pedir para los experimentos. La fecha de entrega de esta tarea es el Jueves 28 de Noviembre en la noche, por lo que tendrás harto tiempo para hacerla.
Por último, este Jueves a las 10 am realizaremos la primera prueba piloto del protocolo para extraer el DNA desde una de las muestras que tenemos!
Nos vemos!
Actividades Semana del 21 de Octubre 3
Matías Alarcón M. 18 Oct18 de Octubre a las 16:52 hrs.2024-10-18 16:52:18 Actividades
Estimado Nico, espero te encuentres muy bien. La planificación de la próxima semana es:
Jueves 24 de Octubre: 10:00 - 13:00 h
- Planificación actividades de pasantía.
- Ajustar protocolo de extracción de heces.
- Diseño y compra de partidores de qPCR para bacteria intestinal.
Si tienes cualquier inconveniente, no olvides avisar!
Jueves 24 de Octubre: 10:00 - 13:00 h
- Planificación actividades de pasantía.
- Ajustar protocolo de extracción de heces.
- Diseño y compra de partidores de qPCR para bacteria intestinal.
Si tienes cualquier inconveniente, no olvides avisar!
- Nos vemos!
Suspensión Actividades Pasantía Semana 14 - Octubre 3
Matías Alarcón M. 14 Oct14 de Octubre a las 17:05 hrs.2024-10-14 17:05:14 Actividades
Estimado Nico, esta semana no tendremos actividades, por lo que retomaremos la próxima semana los días Lunes y Jueves.
Nos vemos!
Nos vemos!
Actividades Semana 23 de Septiembre 2
Matías Alarcón M. 22 Sep22 de Septiembre a las 19:53 hrs.2024-09-22 19:53:22
Estimado Nico.
Esperando hayas tenido unas buenas fiestas, te escribo para contarte que esta semana tendremos sesión sólo el Jueves 26 a las 9 hrs. Te acabo de subir el resultado del western blot que hicimos la semana pasada, con fotos del proceso que no pudiste ver (resultado de transferencia y de incubación con anticuerpo de sinaptofisina).
El Jueves te enseñaré cómo se procesa la imagen de la membrana, para transformarla en un gráfico y podamos sacar conclusiones (no es necesario que lleves delantal). Además, ese día coordinaremos las próximas actividades que realizaremos.
Que tengas un buen inicio de semana!
Esperando hayas tenido unas buenas fiestas, te escribo para contarte que esta semana tendremos sesión sólo el Jueves 26 a las 9 hrs. Te acabo de subir el resultado del western blot que hicimos la semana pasada, con fotos del proceso que no pudiste ver (resultado de transferencia y de incubación con anticuerpo de sinaptofisina).
El Jueves te enseñaré cómo se procesa la imagen de la membrana, para transformarla en un gráfico y podamos sacar conclusiones (no es necesario que lleves delantal). Además, ese día coordinaremos las próximas actividades que realizaremos.
Que tengas un buen inicio de semana!
Actividades Jueves 12 - Sept 3
Matías Alarcón M. 11 Sep11 de Septiembre a las 17:30 hrs.2024-09-11 17:30:11
Estimado Nico, espero estés bien.
Para mañana revisa los dos archivos que subi: protocolo Wblot y de caracterización H/N/SNS.
Además te subí dos videos cortos para que veas sobre western blot que te darán una panorámica general de lo que haremos.
Saludos!
Para mañana revisa los dos archivos que subi: protocolo Wblot y de caracterización H/N/SNS.
Además te subí dos videos cortos para que veas sobre western blot que te darán una panorámica general de lo que haremos.
Saludos!
Actividades Semana del 02 de Septiembre 3
Matías Alarcón M. 2 Sep2 de Septiembre a las 15:10 hrs.2024-09-02 15:10:02 Actividades
Las actividades de esta semana son:
1.- Entregar la guía de micropipetas y 2 pares de partidores para cada gen en la sección tareas.
2.- Leer los artículos de fuente primaria y secundaria en Material Docente.
1.- Entregar la guía de micropipetas y 2 pares de partidores para cada gen en la sección tareas.
2.- Leer los artículos de fuente primaria y secundaria en Material Docente.
Inicio Oficial Pasantía 4
Matías Alarcón M. 31 Ago31 de Agosto a las 14:18 hrs.2024-08-31 14:18:31 Bienvenida - Información Pasantía
Estimado Nico, oficialmente ya tenemos aprobada la inscripción de la pasantía por el jefe de carrera de QyF!
A continuación te dejo un resumen de lo que realizaremos durante tu estadía en nuestro lab durante este semestre:
Este será el primer acercamiento del estudiante a la investigación básica. De acuerdo con su nivel de conocimiento se pretende que se interiorice en alguna(s) técnica(s) básica(s) utilizadas en el quehacer del laboratorio, desde la identificación y manipulación de
micropipetas hasta la determinación de niveles relativos de ácidos nucleicos y/o proteínas, valorando su importancia y utilidad.
En este contexto el estudiante participará en el proceso de estandarización de un protocolo para la extracción de DNA desde las heces de ratas sometidas a estrés crónico por restricción de movimiento. Además, el estudiante determinará la concentración de DNA obtenida, junto con la pureza de sus muestras. Por último, el estudiante determinará el efecto del estrés
crónico sobre los niveles de ciertos genes bacterianos por PCR convencional. Para esto, basado en la literatura y aproximaciones bioinformáticas, el estudiante seleccionará un microorganismo cuya abundancia sea alterada con el estrés, y diseñará partidores adecuados para su identificación.
Durante este período el estudiante indagará sobre los principios de las técnicas utilizadas, su utilidad y limitaciones. Su evaluación será realizada por medio de la redacción de un informe detallado del proceso completo, incluyendo los protocolos estandarizados.
Solicitamos al Jefe de la carrera de Química y Farmacia Dr. Javier Morales considerar esta actividad como electivo de formación general (3 CST), cuya evaluación considerará las siguientes ponderaciones:
Nota de Apreciación (20%): Asociada con el compromiso, disposición y nivel de asistencia que demuestre el estudiante con las actividades propuestas, y la entrega de evaluaciones/actividades formativas a tiempo durante el periodo de la pasantía.
Nota de Informe (80%). Informe de pasantía de investigación que será desarrollado por etapas y de forma paulatina a lo largo de la pasantía. Este informe tiene la estructura básica de 1.- Portada, 2.-Introducción, 3.-Hipótesis, 4.-Objetivo general, 5.-Objetivos específicos, 6.- Metodología, 7.-Resultados y discusión, y 8.- Conclusiones. Se subirá una rúbrica de evaluación y una plantilla del informe a U-cursos con indicaciones y la extensión de cada sección.
A continuación te dejo un resumen de lo que realizaremos durante tu estadía en nuestro lab durante este semestre:
Este será el primer acercamiento del estudiante a la investigación básica. De acuerdo con su nivel de conocimiento se pretende que se interiorice en alguna(s) técnica(s) básica(s) utilizadas en el quehacer del laboratorio, desde la identificación y manipulación de
micropipetas hasta la determinación de niveles relativos de ácidos nucleicos y/o proteínas, valorando su importancia y utilidad.
En este contexto el estudiante participará en el proceso de estandarización de un protocolo para la extracción de DNA desde las heces de ratas sometidas a estrés crónico por restricción de movimiento. Además, el estudiante determinará la concentración de DNA obtenida, junto con la pureza de sus muestras. Por último, el estudiante determinará el efecto del estrés
crónico sobre los niveles de ciertos genes bacterianos por PCR convencional. Para esto, basado en la literatura y aproximaciones bioinformáticas, el estudiante seleccionará un microorganismo cuya abundancia sea alterada con el estrés, y diseñará partidores adecuados para su identificación.
Durante este período el estudiante indagará sobre los principios de las técnicas utilizadas, su utilidad y limitaciones. Su evaluación será realizada por medio de la redacción de un informe detallado del proceso completo, incluyendo los protocolos estandarizados.
Solicitamos al Jefe de la carrera de Química y Farmacia Dr. Javier Morales considerar esta actividad como electivo de formación general (3 CST), cuya evaluación considerará las siguientes ponderaciones:
Nota de Apreciación (20%): Asociada con el compromiso, disposición y nivel de asistencia que demuestre el estudiante con las actividades propuestas, y la entrega de evaluaciones/actividades formativas a tiempo durante el periodo de la pasantía.
Nota de Informe (80%). Informe de pasantía de investigación que será desarrollado por etapas y de forma paulatina a lo largo de la pasantía. Este informe tiene la estructura básica de 1.- Portada, 2.-Introducción, 3.-Hipótesis, 4.-Objetivo general, 5.-Objetivos específicos, 6.- Metodología, 7.-Resultados y discusión, y 8.- Conclusiones. Se subirá una rúbrica de evaluación y una plantilla del informe a U-cursos con indicaciones y la extensión de cada sección.
